約0.3％の差というと10時間だと100秒程度の差となるため気になるというのも理解できます。 プチコン3号のタイマー機能はTIME$、MAINCNT、MILLISECがありますが、TIME$は分解能が1秒（MAINCNTと組み合わせて15フレーム）だけど正確でプチコン3号が起動していない場合も動作しているというメリットがあります。 MAINCNTは誤差が発生しやすいけど分解能は1フレームで表示のフレームに同期しているというメリットがあります。 MILLISECは分解能が1ミリ秒と極めて高くプチコン3号がスリープ中に動くというメリットがありますが、60fpsでの動作であれば実分解能は1フレームとなります。