スコアや残機も、変数で管理するのが一般的ですね。例えば、スコアはSC=0、残機はZK=3、てな感じかな。で、それを常にどこかに表示するようにして、敵を倒したらSC=SC+点数、今はないみたいだけど、敵にやられたらZK=ZK-1として、ZK==0になったら、エンドに飛ばす、といった流れです。