基準クロックによるずれと、計算誤差によるずれとが考えられます。後者の可能性は無いでしょうか。以前、ＭＭＬを使ってストップウオッチを作ったときは、１０時間でもＴＩＭＥ＄とのずれがわかりませんでした。