黒以外の色を使用時はYボタンを押しながらスライドパッドの方向切り替えで8色＋1色の9色の中から選択が可能です。 この色は透明感設定で重ね合わせて書いた場合の透過具合を変えることができます。 Xボタン＋スライドパッドで「透明感」設定を変えると色が薄くなりますが、重ね合わせるかゆっくり書くことで濃くなります。 透明感設定を上げると諧調数が増えるためエッジもより滑らかになります。 この通常モードにおいても色選択が可能ですが、この色は重ね方によって変化します。 水色（シアン）と黄色（イエロー）を重ねると緑色になり、黄色と桃色（マゼンタ）を重ねると赤色になり、桃色と水色を重ねると青色になります。 そして、赤、緑、青を重ねると黒になります。 この重ね合わせによる色の変化は慣れないと難しいですがカラーインクを使って描くのと同じであるためアナログ絵における混色を再現したものと思えば良いでしょう。