私は他人のプログラムの公開キーはすべてコピペで対応しています。 自分が作ったプログラム（これから発表するプログラム）ではコピペが使用できませんが、それは3DSで公開キーが表示されている画面を見ながら他の環境で入力し、入力したものが合っているかを確認しています。 3DS本体以外は何もないという人であればメモを取る必要があるでしょうね。 ただし、メモというのは紙に書く必要はありません。 ドラクエIIをリアルタイムでプレイしてきた私としては50文字のパスワードは気軽に公開するには長い気がします。 しかし、公開キーを発行せずに済むというお手軽感があり一概に判断は難しいところです。 したがって、どちらか片方ではなくパスワードで公開も可能だけどセーブしたものをロードもできる（公開キーを使って読み込んだものも特別な操作をせずに使える）というのがベターではないかと思います。