僕も音ゲーを作っているのですが、元々のBPMに特定の値を掛けて、試運転を繰り返しつつ最適な値を見つける、という原始的な方法をとりました。最終的にBPMに1.02...程度の数を掛けた上で譜面速度を計算させることで無理やり音ズレを解消しました。