私はこんな感じで 開発用のプロジェクトフォルダに入れて使っていますよ。 公開するときは公開用のフォルダをつくり、 必要なファイルだけをコピーして公開しています。 （後はデバッグモードを切ったりする） ファイル名にバージョン入っているのは 特に気にしていません－。