スタートボタンを押して動くのはスロット0です。 スロット1~3は、ダイレクトモードで RUN 1(または2 3)とやらないと動きません。普段スタートボタンを使って動かしてる思うので、普段は0を使います。 あと、セーブするときも、編集中のスロット(または最後に編集画面を表示したスロット)がセーブされます。たぶん何も書いてないスロットを表示してるときにセーブしたんじゃないでしょうか。