左上にある四角を右下にある四角の横(ってゆうか右側)に置きたいのですがどうすればいいでしょうか？

それがBGなら、BGPUT　管理番号,X,Y,BGの設定番号となっていたはずですから、XとYの値を変えれば良いのではないでしょうか。(これは、BGPUTを使っていればですが・・・)

こんな感じですかね、これはBGの設定番号1でやってます。違ったらすいません。

プログラムを書いて頂ければ幸いです。

これだけです。GOTO =LOOP と@LOOPはいりません、ただあった方が良いです。GOTO @LOOP と@LOOPの解説が必要だったら言って下さい、ある程度ならお答えできます。あとBGFILLでXとYの範囲などを決めると、その範囲をそのBGで埋めつくします。

ありがとうございます。出来ました！ また質問なのですが、四角をタッチしたら色を変えて、離したら白色にしたいのですが、どうすればいいのでしょうか？

タッチ系にはまだ手を着けてないので、初心者講座など色々なことが分かると思うので…と言うのは流石にあれなので、何とか調べてみます。分かったら、教えて下さい。見つかった答えを探し続けるのはあれなので。