自作ではなくてメジャーなソフトとかの場合は バージョン番号、リリース番号、マイナーリリース番号 Ver 1.0.2　みたいな表記をすることが多い気もしますが それですら Ver 1.0.2B　のようによくわからないアルファベットがついてきたりして、ソフトごとに何かしら考えてやっているだけだと思うので深く考えなくていいんじゃないでしょうかね。 大きな修正が入らない限りバージョン番号は変更されなくて、細かい修正ならマイナーリリース、大きな修正が入ったらメジャーリリース。 もう、別物みたいに機能がかわるとバージョン番号を修正する。 という感じですかね。