表示していないグラフィック面を使ってフラグ管理するってのはどうですか？ プチコン３号のグラフィック画面はかなり大きいので、ドット１つがキャラクター１つ分として、表示するキャラクター管理用、動ける範囲判定用、敵の位置（当たり）判定用と複数使っても50×30ドットのサイズなら全然余裕ですし。 GSPOITやGPSETで読み書きする座標を指定する時は、それぞれ用途別に確保した領域の座標の左上端の初期値を配列に入れておいて切り替えればいいと思います。