とりあえず保存したファイルがどこにあるか?ですが、現在のプロジェクトフォルダの中にあるはずです。 ダイレクトモードで「FILES」コマンドで使うと「*」がついてないファイルとして確認できると思います。 マップエディタで保存するときに「マップデータとして保存」というのと「BGSCREENデータとして保存」という2種類があったと思いますが、保存するときは2つとも行ってください。