消してしまったのって、ご自分の3DSからでしょ？ 公開しているソフトなら、公開キーでDLすれば、元に戻せるでしょう♪ 公開を中止したり、サーバーから削除してしまえば、どうにもなりませんが、途中経過をサーバーにアップして、公開キーを取得しなければ、データのバックアップとしておくこともできるはずですよ！（私はまだしたことありませんけど…可能な技のはずです♪） または、バックアップ用の別フォルダを作って、コピーを残しておくというのも１つの手ですね♪