3DS本体のアップデートで更新データが配信されているソフトを識別する仕掛けが何か盛り込まれて、該当ソフトは更新データを先に読み込まないと起動出来なくしてるとか？ 何にせよ3DS本体のアップデートが一緒じゃないと、またすぐ配信停止になりそうですよね。