問題点がいまひとつ分からないのですが、セーブデータのサイズを小さくしたいということですか？それともセーブデータの結合、分解処理を短くしたいということですか？ セーブデータにおいてはプチコン3号ではDAT（バイナリデータ）とTXT（テキストデータ）が使えますが、それぞれにメリット、デメリットがあります。