エミュレータ自体は合法なのですが動作させるためのBIOSやシステムROMはプログラムなので本体から吸い出しを行わない限りは違法になってしまいますからね。 当然プレイするためのゲームのROMカートリッジも自分で吸い出しを行わない限りは違法です。 いくらエミュレータそのものが合法といっても違法的な部分を取り除くのは難しいです。 エミュレータではなく移植（プチコン3号上で再現したもの）であっても作ったゲームを自分で楽しむ以外は著作権侵害となりかねないです。 プチコン3号ならばGBA、スーファミくらいのゲームならば再現は可能だと思います。（BGの2軸回転機能を使ったものだと少し厳しいけど）