要するに1秒間に何回実行できるかをカウントすれば良いだけなのでMAINCNTを使ってもTIME$を使っても問題はありません。 1秒以内にfpsを表示したいとか0.1fps単位で求めたいというのであれば少しだけ工夫が必要になります。