試してないので出来るかわからないんですが、MAINCNTが1増えるまでにループした回数を計測して、そのループ回数によってFORのウエイト回数を調節するようなプログラムを書けばVSYNCに頼らずVSYNC以上の速度をある程度調節ってできないですかね? まあでも3DSとNEWの違いだけなら両方でちょうど良い数字を見つけて埋め込むだけでも問題ないのかな…