予想になってしまいますが、きっと絵を描いているときに、透明で修正したつもりで、不透明の黒で塗ってしまっていたのだと思います。 もう一度お絵描きツールで、ちゃんとした透明で塗ってみると良いのではないでしょうか。 私は自作のお絵描きツールを使っているためデフォルトのツールには詳しくないのですが、LかRを押しながら色を変えると背景色が変えられるようなことを聞きましたので、背景色を変えて確認してみると良いかもしれません( ´ ▽ ` )ノ