既に買ってから数ヶ月たつなぁー[本題]MAPを作成してプログラムの中にそのMAPをロードさせてBGSETで当たり判定をつけたら反映されるのですか？(簡単にいえばMAPに当たり判定はつけられるのか？ということ)

当たり判定はつけられます。 変数=BGGET(レイヤー,X,Y) で指定した位置のBG番号がわかります。 これを利用して進行方向にあるBGを調べ、 何番だったら進む、何番だったら進めない、 というプログラムをつくればOKです。

なるほう。